Zabieg polega na pobraniu ze stawu przy pomocy igły znajdującego się tam płynu. Przed jej wykonaniem skóra jest dezynfekowana i podawane jest znieczulenie miejscowe. Następnie lekarz wprowadza igłę do stawu i za pomocą strzykawki pobiera płyn. Igła jest wyjmowana, a w miejscu wkłucia nakładany jest opatrunek.
Zabieg trwa kilka minut, a pobranie materiału daję szansę na dalszą diagnostykę, w tym przypadku szczegółową analizę biochemiczną oraz bakteriologiczną, co pozwala ustalić przyczyny dolegliwości. A w razie potrzeby lekarz przy punkcji może także podać lek bezpośrednio do wnętrza stawu, np. przeciwzapalny, znieczulający.
Zwykle bezpośrednio po punkcji następuje znaczna poprawa związana z odbarczeniem stawu i podaniem do jego wnętrza leku znieczulającego. Należy jednak pamiętać, aby przez dwa dni po zabiegi nie przeciążać stawu. Po upływie kilku godzin od punkcji może wystąpić niewielki ból, który powinien minąć w ciągu doby.